Открыть КриптоПРО с правами администратора.
Перейти на вкладку "Сервис", нажать кнопку "Скопировать"
Откроется окно "Контейнер закрытого ключа", нажать кнопку "Обзор", выбрать нужный сертификат. Имена у сертификатов могут быть очень странные, поэтому лучше предварительно найти нужный через функцию "Посмотреть сертификаты в контейнере".
Нажимаем далее. Появится или не появится окно с вводом пин-кода от вашего USB токена.
Теперь вам необходимо задать имя для копируемого сертификата. Можно выбрать человеческое имя. Не знаю, как это отнесется к кириллице, я предпочитаю не рисковать и русским языком в таких вещах не пользоваться.
На следующем шаге выбрать носитель, затем шаг установки пароля на контейнер.
Копировать можно как в реестр, так и на другой носитель.
Примечание - Иногда попадаются контейнеры, которые не были помечены как экспортируемые.
Следующий шаг - установка закрытого ключа в реестр. Запустить КриптоПРО с правами текущего пользователя.
На вкладке "Сервис" нажать кнопку "Посмотреть сертификат в контейнере"
Далее в окне "контейнер закрытого ключа" нажать кнопку "Обзор".
Выбрать скопированный сертификат.
Нажимаем далее. После чего производится установка закрытого ключа в хранилище личных сертификатов пользователя, через соответствующую кнопку.